Правый приток Онеги. Длина — 183 км.

Берёт начало в болотах в южной части Приморского района, приблизительно в 10 км к юго-востоку от озера Войозеро (которое относится к бассейну Северной Двины, а не Онеги). Река в верхнем течении протекает в основном в южном направлении, затем, когда входит Онежский район, поворачивает к юго-западу. В нижнем течении на реке расположен посёлок Кодино. Устье Кодины находится в месте, где Онега разделяется на две протоки (Кодина впадает в восточную — Большую Онегу), недалеко от деревни Большой Бор. Главными притоками Кодины являются: Сензара, Вычера и Рименга (все правые).

Берега реки покрыты хвойными лесами. Вниз по течению от посёлка Кодино по берегам реки имеются также участки и поймы, занятые лугами.